广明二年六月，当黄巢失败退出长安的消息传遍天下的时候——当然也少不了《大唐日报》的推波助澜，尤其在关中地区，《大唐日报》的影响力日渐增强——原来黄巢任命的各地官员一片哗然，开始各自思考自己的出路。
开始，黄巢所任命的同州刺史王溥、华州刺史乔谦、商州刺史宋岩听黄巢已放弃长安，均率领部众投奔邓州，朱温将王溥、乔谦问斩，而将宋岩释放，让他率军还商州。
然而朱温对黄巢也并不忠心，开始那样做，只是因为他以为黄巢军力仍强，还不到背叛的时候。
随后的战事果然证实了这一点。
此时，除了那些小节度使，从前那些心存观望的其他藩镇的兵马，也加入了痛打落水狗的行列。河东监军陈景思纠合吐谷浑各部、已经叛变黄巢的诸葛爽、感化节度使时溥、鄜延节度使李孝昌等节度使都在诸道行营副都统方彻的号令下围攻黄巢。然而黄巢并不象他们想象中那样虚弱。而这些节度使也对方彻的号令并不怎么买账。
六月十二日，权知夏绥节度使拓跋思恭、鄜延节度使李孝昌二镇节度使，不停纺车的调兵号令，擅自出战黄巢军于土桥（今陕西省旬邑县东南），结果却被重新召集部众，缓过气来的黄巢军大败之！
方彻借此机会下令斥责此二人。并上奏李俨，将此二人降职，权知夏绥节度使拓跋思恭被将为权知夏绥留后（留后相当于副节度使）。鄜延节度使李孝昌被降为鄜延留后。二人知道朝廷是借此机会削弱节度使地权柄，但因忠心于朝廷的十几万大军虎视眈眈，心中虽然不满，也不敢口出怨言。
七月初，昭义节度使高浔与河中节度使王重荣联合进攻华州。不久攻克华州。
这时正在同州防御河东唐军的朱温，因为兵力不足。要求黄巢派兵增援。但这时黄巢已经腹背受敌，兵力明显不够用，哪还有多余兵力派出朱温？朱温屡请不报，渐生异心。
他见到唐军穷追围攻黄巢，知道黄巢已经来日无多。朱温不愧是个枭雄，有很强的战略眼光，何况朱温本身就是个赌徒。参加起义军也只是过了追求富贵。看到大事不妙，便动了背叛黄巢的心思。
于是，在分析了保黄和降唐的利弊得失后，朱温决定降唐。
八月中，朱温杀掉黄巢派来的监军严实，拿严实地人头做见面礼，投降了王重荣。朱温脸皮也比较厚，认王重荣当干舅舅（认干亲在当时非常流行）。王重荣当然大喜过望，连忙认下这个干外甥，并飞报李俨。
李俨对后世历史上终结大唐命运的朱温十分警惕，不过现在却不便收拾他，于是封朱温为河中留后，归属王重荣指挥。
他知道朱温此人野心极大。决不甘心居于王重荣之下。而王重荣也是一个极有野心地人。纵然朱温认王重荣为干舅舅，二人也未必能够相处和睦。
况且王重荣在经过李俨的削弱后，实力大减，而朱温的实力却极强，偏偏处于王重荣之下。所谓主弱客强，必生事端。到时候李俨只需要来上一个挑拨离间，就可以坐收渔利了。
最好朱温能够亲自对王重荣动手，那么李俨就可以以“无故杀害大臣”的名义将之问罪。正是一举两得的好办法。
当然，至于后世历史上那个昏庸的唐僖宗，居然大喜过望的给朱温赐名“全忠”这样留下笑柄地事情。李俨可就不会干了。
随着响应的节度使越来越多。再加上朱温的投降，黄巢的势力在此消彼涨下。更形衰弱。无奈下，黄巢只好接着流窜。
这时候，太原也有不小的事情发生。
奉诏讨黄巢的李克用压根就没有真正的全力讨伐黄巢的意思。他所想地，不过是借此机会，扩大自己的实力。
于是，在七月末的时候，李克用率军进入河东，他给河东节度使府发送牒文，声称奉诏命率兵五万征讨黄巢，要求节度使府沿道准备酒食以供军，并设置邮驿。
河东节度使郑从谠紧闭城门对李克用严设戒备。李克用率军于汾东驻屯，郑从谠派人去犒劳，并送给李克用军资粮草，但李克用驻留多日而不开拔。
他亲自来到晋阳城下呼喊，要求与河东节度使郑从谠相见。郑从谠登上城楼向李克用致意，李克用仍然不肯退去。
到了八月十六日，李克用又要求发给粮饷赏钱，郑从谠送给钱千缗，米千斛。十七日，李克用放纵沙陀军抢掠居民，城中大为惊恐。郑从谠派人向振武节度使契璋求救，契璋率领突厥、吐谷浑兵赶来援救，攻破沙陀军两个寨，李克用率大军出战，追契璋军至于晋阳城南，契璋率军进入晋阳城，于是李克用所率沙陀军队抢掠阳曲、榆次后北归。
李俨闻讯大怒，下诏严词斥责李克用。只是，除此之外，他也没有什么更好的办法。朝廷现在的军队，自保有余，开拓不足。眼下最重要的是肃清关中一带，休养生息，发展壮大，还不是对付这些桀傲不逊地节度使的时候。
此时，李克用已占据了忻、代二州，并屡屡侵扰相邻的并、汾数州。尽管他一直累表请降，但并无归附的诚心，他在寻找着与朝廷讨价还价的砝码。负责防御沙陀的河东节度使郑从谠是当年的名相郑余庆之后，其时以宰相衔出镇河东。领命之后。从谠知人善任，明于治军，一时军威大振，太原一府被朝中称为“小朝廷”，享有极高地声望。从谠与强劲的克用所部在代州一线形成拉锯局面，相持不下。
李克用别号“鸦儿”，当时年纪也只有二十多岁。冲锋陷阵，骁勇无比。沙陀军中称之为“飞虎子”。他一目微眇，时人又谓之“独眼龙”，军略上确实有着过人之处。他有着胡人尚武的天性，善于领兵征战，他手下地沙陀兵善于骑射，战斗力极强。
这些都是李俨搜集到地关于李克用的情报。
此时，行在地朝廷已经迁回长安。但是满堂朝臣。对于这个独眼龙也没有更好地办法。打不能打，赏更是不能赏的，但是朝廷更不能什么都不做，否则刚刚建立起来地朝廷威望，又要毁于一旦。
在方彻的严令下下，河中节度使王重荣率领的河中军和忠武监军并兼行营都监杨复光率领的陈、蔡军，面对黄巢军的极大压力，虽然黄巢军已经衰弱。他们手上加了朱温的兵马，仍然感觉到吃力。而直属李俨的兵马却又被派去维护地方治安，帮不上忙。大军维护治安地理由是信不过节度使军队的军纪，众节度使虽然不满，却也知道自己的军纪的确很差，长安大审判前车可鉴。这个时候他们不敢违背朝廷的意思。
于是，杨复光出了个馊主意：“代州的李克用勇猛无比，又拥有强兵，可为朝廷所用！”
这个提议很大胆，因为此时李克用的沙陀兵正给帝国的北方以很大地压力，屡招不降，并且牵制了一部分朝廷兵力，多少算是一个大患。
王重荣这个时候虽然拥有野心，朝廷的力量还是他不得不畏惧的。况且以他为代表的节度使们的确与黄巢势不两立。他对这个想法颇有顾忌，担心再度因此触怒李俨。从而再度削弱自己的力量。可是不这样做。自己地力量也会在攻击黄巢的时候被消耗掉。这是一个两难的问题。
杨复光知道王重荣的疑虑，他补充道：“其实李克用也早有徇国之志。所以不听朝命，是因为与河东郑从谠有过节而已。若诚以朝旨晓谕郑公召之，克用必来，来则贼不足平矣！”
杨复光也是一个资格颇老的宦官，为人慷慨任气，颇善筹略，在黄巢起兵之初，就出为外镇监军，领兵作战中立有功劳。他和那些只知颐指气使的宦官监军不同，既善指挥，又善抚士卒，因此很有点名望。但是他此番提出的建议却多少有点出于私心，因为他的养父内常侍杨玄价早先曾经当过盐州监军，在招抚沙陀的过程中与李国昌有很大的交情，杨复光本人对此也并不讳言。既然对公对私都有利可图，杨复光有这样地想法就是很正常地了。
王重荣称善，报与朝廷宣慰使王徽。王徽亦以为然。两人再报方彻。
方彻经过仔细的考虑，同意了这个提议。
方彻知道，李俨对李克用非常地忌惮，却有希望能够引为己用。只有把此人放入中原，原理他的根据地，那么无论对付他也好，收复他也好，都更方便。所以他这才同意了这一个建议。随后他飞报李俨，李俨也表示赞许。
于是方彻遂以天子名义颁谕郑从谠召李克用领兵入援。
诏令发出后，一个月不到，李克用即率一万七千沙陀、鞑靼兵入战。取道河东时，克用尚不敢从太原过境，只与数百骑在晋阳城下与郑从谠告别。郑从谠尽管无奈，但也顾全了大局，很客气地送走了这个老对手，还赠了他不少马匹器具。
李克用的参战大大改变了力量对比，对战局起了一个关键性的作用。（这是李俨的嫡系不上战场的情况下。如果李俨的嫡系上战场，其实用不上他。只是李俨需要一定的时间发展生息，不能把自己的军队消耗在这样的情况下，于是李克用就得以发挥作用了。）
十二月，克用兵渡过黄河，进据同州。随后他出征进逼，大败黄巢弟黄揆部。广明三年二月。李克用与河中、易定、忠武三军会合，又大败尚让十五万部众，俘斩数万，伏尸三十里；三月，又与王重荣再破黄巢军，追击黄巢到了陈蔡一带。
此时，驻守凤翔的军队早已经调入长安。李俨便将一部分军队调回来守长安。再将原凤翔驻守军队调出去作战，形成轮换。
李克用等藩镇攻击黄巢地时候。李俨的军队并不是没有任何举动。事实上，维护治安要不了多少人。这些军队除了少部分前去维护治安，其他的大多数都以千人的编制不停的袭击黄巢军——偶尔遇到劫掠的官兵，也对官兵下手。尤其是战役的后期，黄巢军势力被削弱之时，他们地战斗往往对官兵发起。可以说，如果那些官兵不死被莫名其妙的干掉——他们下手得非常隐秘——可能黄巢军垮得更快。总之藩镇兵马地损失远远大于后世历史上的。不少节度使因此消失——他们的部下要么被消灭。要么被收编。
通过这么一来，李俨至少收编了三万兵马（一部分属于原藩镇，还有一部分属于原黄巢军，当然是军纪比较好的。那种军纪极坏的军队，无论是谁，都只有死路一条！）。藩镇的兵马单单是因为被消灭而损失的就有五六万——这些兵马已经成为兵油子了，根本不可能重新成为良民，更不可能成为优秀地士兵。所以尽管杀了他们会因此损失不少青壮，也不得不杀掉。或许等天下平定下来，李俨会给他们一个既往不咎、改过自新的机会，但是现在是不可能的了。
由于他们以强大实力进行的这一切，自然进行得相当快捷和隐秘。其他节度使虽然心中有疑惑，却也不明究竟。至于那些被收编的军队。直接被送回长安，在终南山原来赤卫军的训练之所开始练兵，那里戒备森严，根本没有人有机会将消息泄露。
经过这么一番猛攻，黄巢军流窜到了蔡州（今河南汝南）。蔡州刺史秦宗权打不过黄巢，干脆投降了。
在得到这个消息之前两个月，李俨也接到了刺杀秦宗权失败的消息。想不到秦宗权身边也有不少武艺高手，飞龙军到底还是刚刚成立不久，对这方面能力不足，多达十余次得刺杀都让其逃脱。最后也损失惨重。而秦宗权此人也因此对自己的安全更加注意。难以再有可乘之机。
李俨这时候知道，除非派出空空儿这样地刺杀高手。否则根本不可能通过刺杀的方式对付秦仲权了。然而空空儿虽然因为聂隐娘的原因留在了李俨身边，却不肯为李俨出手杀人，只愿意负责保护李俨的工作。
李俨无奈之下，知道自己只能采用公开的手段对付秦宗权了。
不过，他到底还是想了个办法让空空儿为自己出力：为自己训练特种部队。
空空儿本来也准备拒绝，但是李俨对他说：“刺客者，有为名利而为者，有为恩义而为者，亦有为大义而为者。豫让刺赵襄子，此之谓为恩义。宪宗时藩镇刺宰相武元衡，此之谓名利而为者。唯专诸之刺王僚、荆轲之刺秦，此方为为大义而为之！刺客之道，为名义者下，为恩义者中，唯为大义者，名流青史，非刺客，此侠客也！今君为朕练刺客，刀锋所指，决不对百姓及国人。朕欲行汉武、太宗之事，练刺客者为此也！此既为大义之刺也！君何拒之？”又信誓旦旦的保证：“朕之于君，不设防也！朕若害民昏庸，君可刺之！”
空空儿虽然是一个刺客，却也是一个有自己坚持、自己信念地人，终于被李俨说动，为他训练特种部队关于保护、行刺的课程。
空空儿的事情不提，却说李俨得知黄巢攻到了蔡州，秦宗权投降，知道自己必须出手了。
在后世历史上，黄巢此后攻击陈州，围城一年。此后他们为了解决粮食的问题，“糜骨皮于臼”，“日食数千人”，随后更纵兵四掠，自河南、许、唐、邓、显、郑、汴、曹、徐等数十州，咸被其毒。”骇人听闻的吃人惨案就这样发生了。
李俨之所以想杀秦宗权，就是为了避免这一惨案的发生，此时当然不能任此事再度发生，现在他不出手也不行了。
于是他传旨给方彻，命他调集兵马，全力围攻黄巢，不必再隐瞒实力。
方彻于是开始调集李俨的全部嫡系，一共是十万大军！浩浩荡荡，杀往蔡州。
李克用原本因为自己的五万大军在众藩镇中最强，心中暗自得意。没想到朝廷大军一出，军威如此鼎盛，心中暗自惊惧。
此时黄巢军也已经开始围攻陈州。
秦宗权降后，黄巢前锋孟楷击降蔡州后，志骄意满，又东向急击陈州（今河南淮阳）。
陈州刺史赵犨先示之以弱，小退连连，伺贼军骄急，一举击袭，把万余黄巢前锋军几乎杀个精光，并擒斩孟楷。
黄巢闻爱将被斩，急怒攻心，指挥手下所有部队屯于溵水，与秦宗权合兵，“掘堑五重，百道攻之”，下定决心要拿下陈州为孟楷报仇。
一时间，陈州急攻不下，于是黄巢益怒，在州城北面扎下主营，“立宫室百司，为持久之计”。黄巢这位贼头也好笑，皇帝的感觉上来后就下不去，败北战斗途中，还摆昔日长安的排场。
可是，形势已经不容他再摆什么架子了。李俨嫡系十万大军，已经兵锋直指陈州！