一六三七年九月十八日，这一日对于大和民族来说也许就是“国耻日”，大明一艘满载货物的商船在日本萨摩藩鹿儿岛附近海域失踪，怀疑是萨摩岛津方面因为大明收回琉球主权而恶意派遣军舰伪装成海盗挟持，海军东海舰队对日萨摩岛津含辛茹苦重新发展起来的舰队发动了毁灭性的打击，萨摩岛津的军队被大明海军东海舰队打的不成建制，吐噶剌列岛海域到鹿儿岛海域已经成为大明海军的天下。
明白的人自然知道这个大明蓄意挑起的争端，不过形势逼人强，萨摩岛津昔日对别人挥舞强权大棒，现在也被人家将强权大棒挥到自己头上来了。
萨摩岛津在琉球一战中，至今还没有完全恢复元气，这部日本南部第一强藩不但实力大为下降，在日本国内的影响力也受到了重创，而如今萨摩岛津刚想振作一番，却有一下子打回了原形。
“九.一八”只要是萨摩岛津家族人，每每听到这个都感到抓狂了，这是一个耻辱，一个令萨摩岛津家族永远都抬不起头来的耻辱。
大明提出了“割地、赔款、设立租界以及全方面开放贸易”四大条件，当然这不是对日本幕府的，而是对萨摩岛津家族的。
倭人对领土的那种坚持的确是世界上许多民族都没有的，但是大明的皇帝可相信什么睦邻友好，一衣带水的那一套，萨摩岛津一天不答应大明提出的条件，那大明的军队就不会停止攻击，凡是大明打下来的岛屿和土地，将会直接属于大明，并且从谈判条件中划掉，并重新增加新的土地要求！
萨摩岛津越是坚持。损失也就越来越重，谈判就越失去主动，等到岛津家族发现撑不下去的时候，大明的谈判条件中割让土地一项就足以将整个萨摩都划了过去。更不用说天文数字地战争赔偿了。
德川幕府成了缩头的乌龟，德川家光不是不想管，而是没有能力可管，大明如今的军力已经超百万，海军实力更是雄踞东南亚，加上有琉球这个跳板。随时可以从国内调集数量众多的军队，一旦爆发了与大明地国战，那日本的损失会更大，因此只能忍痛牺牲萨摩岛津了。
德川幕府虽然不想管，但是也不能不闻不问，还是简单的抗议了一下，并且要求介入这一次商船被劫一案的调查，不过军情司做事从来都是滴水不漏的，又岂能让日本方面抓到什么把柄。所有证据都指向萨摩岛津，而且还搞出了人证，并且在萨摩岛津家族的一个秘密训练基地地找到了装载商船货物的不部分，以及被杀害船员的尸体，这下子，不但萨摩岛津家族是焦头烂额，连日本幕府也被动的下不了台了。德川家光头上那有限的几根毛发都差不多被他扯光了。
谁都知道，日本到了一个十分严峻的时期。德川家光不是笨蛋，不然他老子也不会将德川家交给他了，而这个时候又一件对日本影响深远的事情发生了，让德川家光根本没有精力去管萨摩国的事情了。
这件事就是发生在肥前国的岛原半岛，本属外样大名松仓氏所领。当时地松仓氏家督为松仓胜家。是个冷酷无情而又贪得无厌的家伙。这一年秋季，岛原半岛及其南方的肥后国天草群岛闹起了大饥荒。可是松仓胜家仍然按照旧例征收年贡，并将交不起年贡的数名农民残酷处死。
农民们生活在死亡边缘，已经沉寂很久的天主教信仰随之再度抬头，秘密信教以逃避残酷现实的百姓越来越多。此事为松仓胜家所查知，就在领内搞了一次大清洗，逮捕了很多教徒，要他们举行“踏绘”的仪式。所谓“踏绘”，是指将刻有耶稣受难像地木牌扔在地上，让怀疑为教徒者用脚去踩，肯乖乖从命的定非天主教徒，或者虽是教徒却有心悔改，否则就将被处以火刑。这种方法并非松仓胜家所创，而是幕府搞出来并到处推广地无聊花样。
阶级压迫和宗教迫害双重利刃就此加在岛原百姓头上，他们无路可走，被迫铤而走险。九.一八事件发生后一个月，岛原有马村纷起起义，杀死了松仓氏的代官林兵右卫门，并且攻破藩武器库，团团包围住了松仓氏的本城——岛原城。
十月二十七日，天草群岛也爆发起义，与岛原起义南北呼应。天草群岛乃是肥前国唐津的谱代大名大久保氏的飞地，唐津藩地代官三宅重利领兵镇压暴乱，却于十一月十四日被起义打败，身首异处。天草起义进而包围了富冈城。
消息报至江户，德川家光将军大为恼火，立刻派遣重臣板仓重昌前往九州，纠合附近诸侯前往征伐。岛原、天草地起义闻报，结合为一，后退到已经废弃的原城，笼城固守。原城在“岛原、天草之乱”爆发前，虽被废置不用，基本地土垒木墙还没有被扒平，这就给了起义军一个很完美的根据地。
有趣的是，起义军的首领却是一个年仅十六岁的少年，俗称为天草四郎时贞。据说这位英俊少年乃是上帝派遣来拯救生活在水深火热之中的日本天主教信徒的，具有莫大神通，教徒们无不尊奉他为“天人”、“天使”，一切都唯四郎时贞马首是瞻。
天草四郎，他原本的苗字应该是益田，乃是小西行长的家臣益田好次之子。本名益田时贞，父亲益田好次是小西行长的家臣。后来时贞被过继给天草甚兵卫，改名为天草时贞。天草自小聪颖过人，有神童之称，且外表俊秀。有一位相士曾对天草说：“阁下面相尊贵，本应掌握天下，只可惜生在德川时代，难成大事。”
关原合战后小西行长被斩首，领地遭改易，家臣们纷纷四散成为浪人，据说四郎时贞从小就居住在长崎港，虔诚地信奉天主教，并向旅居日本的荷兰人学习过西洋医术——所谓神通广大，能活死人，肉白骨，大概不是完全的空穴来风吧。
且说板仓重昌来到岛原城中，集合了包括松仓胜家、锅岛胜茂、有马丰氏等周边诸侯，集合兵马，向原城发起了猛烈进攻。重昌一开始并没有把起义放在眼里，认为那些作乱的农民无拳无勇，根本不懂打仗，如何会是幕府军的对手？然而一连发起两次总攻都未能得手，己方反而损失惨重，重昌不禁涔涔汗下，意识到原城中定有深通兵法之人存在。
北九州地区乃是天主教传播的中心区域，战国后期有大量平民甚至武士都皈依了天主教，这些人在“大殉教”后都被迫潜伏了下来，趁着这次动乱再度抬头。因此固守原城的并非仅仅数万农民，其中也掺杂了很多信奉天主教的浪人——四郎时贞首先是这些浪人们的领袖而这个肥前、肥后两国跟萨摩国却是紧密相连，如此爆发了大规模的起义战事，幕府就算有军队也顾不上他了，而且这个时候自己领地也出现了不稳的现象，形势急转直下，迫使萨摩岛津向大明低头，开始和平谈判！
和谈对萨摩岛津来说更加是一种煎熬，每达成一条协议，萨摩自身的损失就加重一分，就好像看着比人从自己身上剜肉一般，清楚的看到那锋利的刀落下在提起，刀刀见血，寸寸到肉。
经过两个多月的谈判，大明与萨摩岛津终于达成最终的和平协议，并通过日本幕府同意正是签署，史称《鹿儿岛条约》。
鹿儿岛条约包括如下内容：
大明立刻停止对萨摩岛津的一切军事行动；萨摩岛津公开澄清琉球归属大明的事实，并且日本幕府承认大明是其宗主国，不过这一条日本幕府开始不承认，但是后来为了得到大明军事上的援助，而解决国内岛原、天草之乱，因此达成了一个秘密协定，没有对外公开。
日本萨摩藩割让吐噶剌列岛及所有附属各岛屿给大明，这些岛屿日后将属于大明琉球行省，大明将派军队进行驻守。
萨摩藩赔偿大明军费二百万两白银；另商船的损失以及船员的伤亡失踪萨摩藩也要做出相应的赔偿，并郑重向大明道歉萨摩藩开放鹿儿岛郡、川内为商埠，同时日本幕府也答应对大明开放长崎、福冈、日南、宫崎等九州岛中南部数个港口为商埠，并在鹿儿岛设立租界，租界区域内立法行政以及安全都将有大明负责，租界之民并享有外交豁免之权。
允许大明商人人在日本通商口岸设立领事官和工厂及输入各种机器，并且还享受低额的税收，彼此的最惠国待遇；
日本国不得逮捕为大明军队服务的人员；
吐噶剌列岛内日本国居民，两年之内任便变卖产业搬出界外，逾期未迁者，将被视为大明公民。
条约批准后两个月内，两国派员赴鹿儿岛办理移交手续。
因为条约在萨摩藩的鹿儿岛签订的，所以这份合约理所当然的就被称之为《鹿儿岛条约》。