帝国的主力舰队消失之后，大量帝国殖民星系就暴露在了联军的攻击范围中，并连续引发了帝国官员和富豪向帝国内部撤离的浪潮，由于索尔通道已经被联军占领，只能绕道六千多光年以外的卡纳兹星系逃往帝国，但是反帝同盟的萨摩也正在向卡纳兹星系逼近，同时抵抗组织的活动也是空前活跃，使这一带所有星系都处在不断发生的袭击事件和攻击中，这就更增加了这种恐慌的趋势。
这次战役共歼灭击溃了银河帝国的一个战区司令部，四支一级舰队和九支二级舰队，俘获各类大小战舰和其他辅助飞船近万艘，还俘虏了以帝国元帅巴鲁为首的四百多万战士和军事人员，并趁势占领了三十一个星系的四十七颗人类聚居星，可谓战果辉煌。
经过这次战役，联军的控制范围一下从死神星区向外扩张了将近一千光年，加上死神星区，联军目前的规模已经基本相当与一个中等国家了，而这才不过是一个开始，另一个更大的计划正在酝酿之中。
在霹雳行动中，无论是半神组织的成员还是天狼的将领，只要是有过指挥作战经验的将领，都被委以重任，其中也包括很多原来帝国第一舰队的将领，尤其是在战役的第二阶段中，随着联军攻击范围的扩大，这些将领大多都成了联军大小舰队的指挥官。宇灵在这次战役中的表现尤为突出，不但在超空间和反空间都圆满完成了任务，还在战役后期大展拳脚，在联军的所有舰队中，战绩仅处于龙星和天狼之下，表现出了卓越的军事才能。
半神组织和天狼帝国联军的这一战再次震动了银河，受到巴鲁全军覆灭的影响，舒尔特的军队更是士气低落，在萨摩和金阳的攻击下节节败退，罗森此时看到帝国大势已去，加上他与帝国的联系已经基本切断，随即宣布脱离帝国，成立基尔库克共和国，先释放了四万多名在战争中俘获的反帝同盟战俘和间谍，又相继派出多个使节团，向反帝同盟和半神联军求和，并立刻正式向帝国宣战。
对于罗森的这种反应，金阳和龙星早已料到，为了先推翻帝国，各国相继都接受了罗森的请求，使得舒尔特更加孤立，在龙星宣布将参加对舒尔特的防区攻击后，金阳和萨摩也宣布了反帝同盟和半神联军的同盟关系，绝望的舒尔特经过一段时间考虑后，毅然率领他的部队向正在调动军队的龙星投降。
由于舒尔特长期以来一直与反帝同盟为敌，加上他以前也和尼玛有过冲突，是以他没有选择实力雄厚的银河联邦，同时因为也巴鲁落到了半神的手中，他投降后不但可以为巴鲁取得一个比较好的待遇，也便于以后相互照应。
前线的巨大胜利也挽救了正陷入国内危机的金阳，在尼玛率领圣灵舰队返回亚特兰蒂斯后，立刻向议会提交了罢黜金阳的提议，并提名莫平来接替金阳指挥整个反帝同盟的指挥，这个计划虽然勉强通过了议会审查，但是却遭到了来自联邦军方和反帝同盟其他国家的强烈反对，在金阳通过智能网络发布了对尼玛的指责之后，联邦公民也很快分成了两大派，支持金阳的公民远远超出尼玛的预料，使得他虽然在政府中取得的优势化为乌有。
金阳在前线取得的一系列胜利，让他的声望迅速把尼玛压了下去，绝大多数公民都不想在金阳取得这么大的战绩后罢黜他，加上公民们对尼玛主持联邦这么久以来的不满，使得在民间的反对意见和指责一浪高过一浪，最后逼迫政府不得不否决了尼玛的这项提议。
尼玛在政府中遭受了联邦建立以来最大的挫折之后，一直处在狂躁的状态中，尤其是在知道了半神联军的领袖是龙星之后，尼玛几乎被气得失去了理智，整天在圣殿中诅咒这个可恨的古代怪物，没想到他居然被一个古代人玩得团团转，最后，尼玛把这一切的仇恨都集中在了龙星身上，他认为这个危险的古代怪物不仅造成了联邦目前的危机，还破坏了他在人类心目中的地位和声誉，这个念头让尼玛彻底失去了一向的冷静，每日里只是盘算着怎样向龙星报复。
金阳在解决了国内的危机之后，立刻与萨摩和龙星兵分两路，发起了规模空前的“雷神行动”，萨摩和他原本的对手舒尔特率领大军沿卡钠兹星系向帝国展开攻击，金阳则与龙星合兵一处，并挟持着罗森也派出了他的一支舰队参与行动，以免罗森在后方突然发难，现在他正处在联军的包围之中，只要抽调出他的一半兵力，罗森就不敢在联军进攻帝国的时候在后方捣鬼了，联军在突破索尔通道后分成十六支大小不等的舰队，对乱成一团的银河帝国发动了狂攻。
巴鲁的全军覆灭和卡洛斯舰队的全面崩溃，再加上舒尔特的投诚和罗森倒戈，彻底摧毁了帝国军队的信心，看到反帝同盟和半神联军兵分几路如排山倒海一样的攻势，不但帝国的战士对整个战局感到悲观，连帝国军队的大脑统帅部也几乎已经绝望了，虽然帝国统帅部向前线部队紧急装备了基因武器，命令军队在遇到攻击时在星际空间散布，但是大多数帝国舰队根本就没有使用，虽然也有一些舰队在战斗时使用了基因武器，但丝毫没有阻挡住联军进攻的速度，反而造成了大量的平民伤亡，使帝国公民对政府更加的痛恨。
面对反帝同盟和半神联军的穷追猛打，元气大伤的银河帝国不住收缩防线，想利用舍弃一些星系来减缓盟军攻击的速度，来换取一定的准备时间，无奈目前已是大势已去，勉强拼凑起来的一线军队一触既溃，加上抵抗组织利用帝国无力维持国内的安全局势，频频发动袭击，造成了帝国内部极大的混乱，让焦头烂额，捉襟见肘的帝国雪上加霜，再无反抗之力。