他的身体再也不如从前，辛劳的工作已经使他体力不支，顽固的痣疮使他痛苦不堪，尽管太医做了好几次手术，都没有能彻底解决。他不能坐在椅子上，半坐伴卧的处理着那些没完没了的公文，疼痛难忍。他的身心正在受着痛苦的煎熬。由于工作繁忙，顾不上服用药物，没有时间让太医诊治，致使病毒不断的繁殖，病情不断的恶化，五脏六腑已被病毒侵蚀，像一个勉强支撑的稻草人，一旦有个风吹草动，就会彻底倒下再也不能站立起来。

然而，张居正还是不能休息。偌大的一个国家，当家人就他一个，诸多的事情由他去处理，不敢想象他一旦离去，大明朝将会是个什么样子。他知道在这个世界上的时间不会太长。他正在发愤的工作，要在有限的时间内把清丈土地的事情做完，不留下任何的遗憾，他向段正茂许诺，等完成这件事情就要辞职回家。

就在张居正万分痛苦的时候，万历皇帝正在干什么？他也在忙碌着，每天昏天地黑，与夫人们如胶如漆，难舍难离，缠绵无度。他也不用偷偷摸摸，大婚以后皇宫里的女人，除了被父亲临幸过的都是他的女人。他掉进温柔乡里，日日寻欢，夜夜**，哪有时间去处理政务。当他体会到**的快乐后，就不再想朝廷里的事。反正有张居正抵挡着，不许他操心，大臣们也知道万历每天不上朝，有张居正当家，对于万历就不在追究了，由他去吧！

张居正的身体越来越不听话，再也没有以前的充沛精力，只要一动身就会头晕眼花，气喘吁吁。只好由侍从把每件公务念给他听，由他提出处理意见，他已经没有力气动笔了。

在全国清丈土地已经三年，这段时间，这项工作虽然还没有完成，各项工作都取得了很大的进展。全国清丈出的土地数量大量增加，三年清丈出的土地比嘉靖四十一年增加2712282倾，工作取得了很大的成绩。

为了这些成绩的取得，倾注了他毕生的精力，付出了极大的代价，把个人的生死荣辱都丢到脑后。被张居正处理过的那些王公大臣对他恨之入骨，明面上不敢对他如何。难以想象，在他百年以后会是个什么下场，张居正不断地想着这些，也经常在各种场合对同僚们说起这个想法。

他不断向李太后提起辞职，期望能在完成清丈土地工作以后，回家修养，颐养天年，享受天伦之乐。李太后可不听他那一套，除了不停的赏赐，干脆就把口子封死，说：“万历皇帝不到三十岁之前，不允许张居正辞职。”

这可把痛苦不堪的他愁毁了。

张居正这时是有想法的，他的工作已经做完，十年的工作，他把濒临死亡的大明帝国从死亡线上拉了回来。大明朝已经进入中兴时期。为了改革，他已经把全国的特权阶层得罪光了，对自己将来的下场已经有所感悟。更令他无法放心的是皇帝已经二十岁，虽然他不理朝政，毕竟已经长大了。如果现在把权力交出来还比较主动，如等到向他索要政权的时候就为时已完了。