“胜利！——”此时，阿库斯战舰内的全体汽车人齐声欢呼。而擎天柱也开始登上台来，展开他的演说家才能：“汽车人们，这场战争，持续了无数年的战争，杀死我们无数同胞、毁灭了我们家园的邪恶战争，今天终于结束了！这是一个值得庆祝的日子，我们变形金刚，还有整个赛博坦，将迎来新的明天……”擎天柱慷慨激昂地演说一番之后，又对投降的霸天虎们展开劝说，“……是的，你们曾经是我们的敌人，你们之中也有人参与了毁灭家园那场邪恶战争，更是接触了邪恶的能量，灵魂遭到侵蚀。但是，从今天起，你们将重新成为我们的同胞，我们毕竟同宗同源。只要你们接受我们的改造，洗净身上的邪恶能量，净化自己的灵魂，用行动证明自己，和我们一同重建家园，那我们从此就是兄弟姐妹！在我们的共同努力下，赛博坦一定会恢复旧日的繁荣，一定会拥有更美好的明天……”
不得不说，擎天柱确实有演说家的才能，在他的鼓舞下，全体变形金刚都士气高涨，恨不得马上就开始重建赛博坦。而霸天虎们除了红蜘蛛那样的野心家或者声波那样的死忠分子，绝大部分都抛弃身上的狂派烙印，加入了博派。于是，重新加入博派的霸天虎将要接受改造，而红蜘蛛等人则被囚禁起来。
正在变形金刚们准备狂欢的时候，刘云忽然走了过来，带来一个不好的消息：“我要告诉大家一个真相：这场战争远未结束。战争的根源不是因为变形金刚划分为两派，而是因为宇宙大帝！现在，你们的始祖——元始金刚已经恢复了一部分能量，就让他来解释这一切吧。诸位，请离开这艘破损的阿库斯战舰，回到我的舰队中来，或者回到垃圾星临时基地，这艘战舰残骸即将遭到拆解处理……”
刘云安排好阿库斯战舰之后，便把所有变形金刚请到一颗卫星要塞的表面上，直接面对着巨大的赛博坦行星。
忽然，赛博坦行星开始动了！巨大的行星，表面发出红色的光芒，大地开始分裂，不，是整个行星开始缓缓变形！
“隆！隆！……”不愧是元始金刚，那二十万公里高的庞大身躯，变形的每一步都声势惊人，但代价是能量消耗巨大。花了整整两个小时，元始金刚才变形完毕，此时，化为行星本体的元始金刚微微有些气喘，看来能量还是不足。
此时，元始金刚向他的子孙——所有的变形金刚说话了：“我的孩子，我就是你们的父神，没错，我就是圣典中记载的元始金刚，你们都是我的孩子，但在这几千万年里，我没有好好保护你们，没有好好教育你们，还让你们互相残杀，这是我的罪过！”
听见他们的创始神元始金刚竟然道歉，一众变形金刚急忙惶恐地单膝跪地，擎天柱代表所有人说道：“不，父神，这根本不是您的错，而是我们自己心生邪念才会开战，现在霸天虎也已经是我们的一员，他们已经认识到以前的错误，请父神不要责怪他们。”
“唉！”元始金刚叹了一口气，道，“擎天柱，我已经关注你很久了，看来你确实是一名合格的领导人。既然现在变形金刚重新团结起来，在你的领导下我就放心了。不过，对于霸天虎为什么忽然野心膨胀这件事，确实不是你们的责任，而是因为他们遭受一种邪恶能量的侵蚀。能量本来没有正邪之分，但这股能量却不是天然能量，而是来自一个邪恶之神——宇宙大帝。宇宙大帝和我来自同一个空间，但他是我的死敌，他发誓要杀了我，并且毁灭我所创造的生命。来到这个宇宙之后，宇宙大帝一直都在追寻我的踪迹，数万年前，他终于达到一个离我相当近的地点，然后向这里输送了一股饱含他的灵魂之力的能量——这就是你们所说的暗黑能量，暗黑火种。宇宙大帝选择了威震天作为他的代理人、棋子，他让威震天掌控了一部分暗黑能量，然后挑起赛博坦大战，最后打得恒星毁灭、行星也失去所有能量，赛博坦变成现在这般残破。不过，那恒星也不是你们所看到的那样，是威震天摧毁的，谅他一个小小的变形金刚，也根本没有能力摧毁恒星这种存在，实际上是宇宙大帝暗中捣鬼毁掉赛博坦恒星，那就是黑暗之日的开始。”
此时，擎天柱忽然问道：“那么，请问父神，既然宇宙大帝挑起的内战已经结束，那么他肯定不会善罢甘休，他会不会再次启动一些恶毒的阴谋呢？”
元始金刚摇摇头，道：“不会，他再也不会使用阴谋了，因为他已经来到我的附近，很快就会到达这里。到时候，他将要堂堂正正地打败我，消灭我，这就是我说战争远未结束的原因。我知道，因为我的错，我没有让你们及早成长起来，数百万年时间都浪费在无休无止的争战之中，现在的你们没有抵挡宇宙大帝的实力，而我自己也能量极度不足，不是宇宙大帝的对手。所以，我请来了四位盟友，你们也认识了，他们就是来自地球的四位舰队指挥官。你们没有成熟的能源技术，而这正是地球盟友的所长，他的到来，给我送来一笔可观的能量，但宇宙大帝很快就要到来，时间不够，他们也没法累积起足够的能量让我直接对抗宇宙大帝。当然，我们也不必惧怕宇宙大帝，因为我的这四位盟友都拥有神奇的手段，相信我们联手之下一定有获胜的机会。”
元始金刚顿了一顿，继续道：“现在，擎天柱，我交给你一个重要任务！你带着所有剩余的变形金刚，乘坐一艘神龙母舰——也就是地球盟友的母舰，前往他们的基地——南门二星系。你们一定要保存变形金刚的火种，万一我战败了，你们要潜心发展，等自己实力壮大后再找宇宙大帝报仇，消灭这个银河系的祸害！但要记住，你们是同宗同源的一族，你们都是我的孩子，绝对不能再自相残杀！否则，你们一定会走向毁灭，宇宙大帝是不会放过你们的！”
“父神！”变形金刚们十分不舍，根本不想离开赛博坦，也就是他们的父神，甚至有些汽车人说要留下来和宇宙大帝决一死战。不过，此时擎天柱劝道：“同胞们，不要说了，我理解父神的意思，他不想让我们白白送死，而要我们把变形金刚的火种永远传承下去。至于战斗，就交给父神和地球朋友吧。这一次，我们欠地球朋友太多了，我擎天柱以领导身份代表全体变形金刚宣布：地球永远是我们的盟友，而变形金刚一族也将永远守护地球，以报答他们的恩情！”
于是，在元始金刚和擎天柱的劝说下，所有变形金刚都乘坐神龙母舰前往南门二星系。现在，赛博坦星系中只剩下元始金刚和刘云四人。
刘云忽然看了一眼远方的天空，那边有一颗亮星，正在朝这边高速移动，刘云知道那就是宇宙大帝。“照这个速度，宇宙大帝将在一个月之后到达这里。元始金刚，你确定你有足够的能量与之战斗？”
元始金刚摇头道：“不可能，一个月后我的能量最多达到十分之一，虽然可以和他一战，但战胜的概率实在太小。刘云，你确定你的的舰队有能力打得过他？”
刘云道：“我也不知道，但总要试一试。我马上带着一支分舰队去试探一下宇宙大帝的实力，如果不行，那就回来改造舰队。堕落金刚那艘阿库斯战舰还有很多技术没有掌握，如果把这些技术应用到我的舰队之上，肯定会实力大增。可惜时间仍然不够……”
不论如何，刘云还是带着三千艘战列舰、两万艘战巡舰的分舰队出发了。宇宙大帝已经距离赛博坦不远，舰队可以瞬息即至，但宇宙大帝却没法瞬间过来。这就是刘云的机动力优势，就算打不过还可以退回来。
忽然，系统传来一阵提示：“刘云、梅青、白万松、朱小妍四位玩家请注意，你们的任务目标是消灭宇宙大帝，如果没有消灭，将不能离开这个时空！如果元始金刚阵亡，你们也必须滞留这个时空！”
“什么？！”白万松听到这个消息，前半段还正常，听到后半段就愤怒了。消灭宇宙大帝这个任务确实难了点，但也不是不可能，系统若拿“完不成任务就不能走”这条理由来说事也算正常，可后半句算什么？如果元始金刚阵亡，那也不能走？也就是说一定要保住元始金刚，这难度也太大了吧！要知道，宇宙大帝就是冲着元始金刚来的，对元始金刚的仇恨值最高，而元始金刚自己则极度虚弱，说不定打两下就挂了，有什么办法能保住他？
刘云原本打算让元始金刚和宇宙大帝去血拼，然后自己从中渔利，这才是损失最小的做法。但系统这样做，就是要强迫刘云去和宇宙大帝血拼了。
听到这个消息，刘云无言以对，只能平静地道：“算了，我们走吧，先试探敌人的实力再做打算。”
与此同时，时空战场的深处，天邪正一脸阴险地笑着，仿佛阴谋已经得逞：“哼，你们几个华族小子真是好本事，竟然这么快就拥有三极文明的航行技术，使得整体科技水平已经超越普通的一级文明。如果他们以这种实力进入最终时空，肯定会获得极大地初期优势，会极大破坏玩家之间的平衡，所以我要尽可能削弱，甚至消灭你们辛辛苦苦建立的舰队！碍于规则所限，我不能直接出手，但借助‘宇宙大帝’和‘元始金刚’这两个外来者之手就可以达到目的！
元始金刚和宇宙大帝这两人是异空间来的拥有亚圣级别能量的高手，虽然他们的能力有很多限制，科技也不完善，但总归是时空战场的一大不稳定因素。那宇宙大帝虽然归顺了系统，但总不是自己人，不能留他！先让宇宙大帝出手杀死元始金刚，用规则把那几个华族小子永远限制在那个时空，然后借那几个华族小子之手严重削弱宇宙大帝，最后我再出手消灭他。如此，就能一石数鸟，哼哈哈哈……”
原来，天邪打的是这个主意，他玩的就是让别人自相残杀，然后自己做最后那个黄雀。可惜，他对刘云的实力仍然误判了，以为刘云只是在心神方面有优势，但却不知刘云最近掌握了控制庞大能量的方法，已经今非昔比了。有这么一个因素在，就让天邪的计划完全落空！
刘云带着分舰队刚想出发时，远处的星空中忽然传来一阵空间咆哮，只听见宇宙大帝激动地怒吼道：“元始金刚，我已经来了！我已经找到你了！这数千万年来，我一直在找你，我的‘兄弟’！你不是一直害怕我把你杀掉吗？很好，现在你担心地事情终于到来了，去死吧！——”说罢，一股庞大的暗黑能量穿越了空间，直接向元始金刚袭来！
“吼！——”那股暗黑能量化为一个行星大小的黑虎头，咆哮着向元始金刚袭来！不幸的是，刘云的分舰队正好挡在黑虎头和元始金刚之间！
“完蛋了！”梅青看见前方一个巨大的黑虎头迎面扑来，顿时吓得花容失色，紧紧地闭上双眼。白万松在电光石火之间打开了“任意门”，准备逃回垃圾星基地。此时，刘云怒吼一声：“不准走！——”
“**，竟敢趁我不注意偷袭！你打元始金刚也就罢了，竟然还敢打我！”刘云一边怒骂着，一边调动他所有的能量，凝聚成一面巨大的金盾，挡在舰队面前！
“轰隆！——”黑虎头重重地撞在金盾之上，两股庞大的能量猛烈碰撞，发出惊人的声势，那光芒仿佛超新星爆发一样，照得所有人睁不开眼！不过，宇宙大帝的能量实在惊人，刘云在这方面的修为尚浅，那金盾险些维持不住，摇晃了几下，而刘云本人则被能量碰撞的巨大反冲重重地摔在墙壁上，一缕鲜血从嘴角流了出来。
“哪里来的讨厌鬼，竟敢抵挡伟大的宇宙大帝的攻击！”此时，宇宙大帝相当愤怒，待他看清楚后，顿时大笑起来，“哈哈，渺小的蝼蚁也敢跟宇宙大帝对抗，真是自取灭亡！看我的暗黑能量把你全部吞噬！”说罢，宇宙大帝再次穿越空间送来一股能量，黑虎头得到增援，声势更加陡增！
“**，宇宙大帝果然强悍！”刘云挣扎着站起来，抹了一把嘴角的鲜血，道，“你们快走吧，我留在这里抵挡。”
“不！我不走，我要留下来帮你！”梅青流着泪，急忙跑过来扶着刘云，此时，她也动用自己全部的心神和全部的能量，融入刘云的心神之中，顿时，那面金盾得到了一些支援，渐渐稳住了脚跟。
“我们也来帮忙！”白万松和朱小妍也跑了过来，将心神和能量放出来支援刘云。顿时，那金盾重新振作起来，严阵以待黑虎头的攻击。刘云看了一眼梅青，又看了一眼白万松他们，没有说话，但眼神中透出一种感动。
这时候，那黑虎头再次咆哮着冲了过来！“吼！——”这一次，虎头中的暗黑能量到处肆虐，卷起一阵阵罡风，这些暗黑能量直接涌过来攻击刘云的心神！刘云咬着牙，准备抵挡这更加猛烈的攻击，这次他已经做好受重伤的准备。
“嗞！——”突然，暗黑能量组成的罡风和刘云四人融合的心神相撞，就像烧红的铁块投入大海中一样，虽然铁块很炽热，激起阵阵白眼，但大海更加宽广浩淼，铁块只能汽化一小部分的水，却被大海直接吞没！
“哈哈！原来宇宙大帝也不是无敌的，他的心神竟然弱成这样！”刘云顿时大喜，因为他发现，宇宙大帝虽然能量庞大，但心神强度比元始金刚还弱。宇宙大帝想用他的“灵魂力量”，也就是那种暗黑能量，像吞噬变形金刚一样吞噬刘云的心神，没想到撞到铁板了！于是，那股暗黑能量中蕴含的宇宙大帝的心神（灵魂力量）瞬间被刘云消灭，这股能量顿时变成无主的！
“快！快收了！”白万松连忙提醒道。刘云毫不迟疑，瞬间把这股能量给收了，顿时，他们四人的修为又上涨了几分！
此时，刘云主动出击了！他利用心神的优势，尤其是四人融合的心神，比他自己更加强大。刘云立即凝聚出数十根金色长矛，向黑虎头穿刺而去！这些金色长矛中携带着他们的心神力量，瞬间削弱了黑虎头的灵魂，顺道带起一股股无主的能量，直接吸收掉了。就这样，金色长矛来回穿刺，每穿刺一回，就壮大一回，这样此消彼长，没过几分钟，宇宙大帝发出的这股暗黑能量全部被刘云他们消灭，而其中的能量被当成战利品吸收掉了！
“哈哈！”刘云吸收了巨额的能量，红光满面，他现在所能控制的能量竟然增长了八成！就连功法本身也有进步，已经达到中级操作系统的巅峰了，说不准哪天就能突破。进步最大的不是刘云，而是梅青三人，他们原本比刘云弱很多，因此获得的好处最多，现在他们的心神强度更是暴涨，直接达到“亚圣”初期，控制的能量也到达“大罗金仙”巅峰，只差一步就达到“准圣”的级别。
此时，刘云已经掌握宇宙大帝的弱点，现在他很有信心消灭这个大敌！