五千年前，人间开始出现文明的雏型，地面被许多势力所瓜分，其中以东方的情形最惹人担心。因为其中一股巨大势力，由有魔族血统的赤帝蚩尤所控制，展现了统一地面的才能及野心。
能够制衡蚩尤的就只有黄帝轩辕和炎帝神农，然而这两个氏族首先打起上来。最终轩辕黄帝打倒了炎帝，并且收编了其族人，实力大大增强；但连场激战让轩辕黄帝元气大伤，一时间无力抗衡蚩尤的进袭。天帝有见及此，遂派遣上古战神九天玄女下凡帮助轩辕黄帝，抵挡蚩尤入侵，并传授他神兵和神技。
九天玄女来到人间，加入了轩辕黄帝的军队。虽说轩辕黄帝也是雄才大略、风度翩翩；其部属多受教养，没有其他氏族的野蛮，但对于九天玄女来说，人类的落后仍使她烦厌。想要尽快完成任务的九天玄女，决定自行解决蚩尤。
蚩尤再强亦不过是半个魔人，而且只有数百年道行，如何与九天玄女相比？虽然与天帝的原意有少许出入，如果能够杀死蚩尤，相信其氏族亦会随之瓦解，人间得到真正的和平。那时候没有诸神协定，神魔干涉人间事务本来就天经地义。
九天玄女带著神兵昆吾剑来到蚩尤的根据地，指名挑战。然而当蚩尤带领著八十一个悍将走到阵前，九天玄女却不其然的感觉心旌摇曳！可能有著魔族血统的关系，蚩尤身高超过两米，背厚腰阔，魁梧非常；他长得铜头铁额，浑身皮肤泛著金属般的光泽；头上长著一对又尖又弯的长角，显得更威武、凶恶。尤其那双如铜铃般大、会放光的眼睛，差点便迷住了九天玄女。
虽然只是数百年道行的魔人，但是蚩尤的气势、自信还有风范，在天界找不到第二个。
两人的战斗无法避免，九天玄女拔出神兵昆吾剑，驾云向蚩尤飞过去。蚩尤不懂得飞翔之术，伸手拍了拍坐骑飞虎，飞虎四爪在地上一蹬，已载著蚩尤飞上半空。
蚩尤双手在腰后一探，左手刀右手斧，将九天玄女的昆吾剑抵住。
昆吾剑乃是天界神兵，寻常兵器莫不能挡。九天玄女定睛一看，蚩尤左手握著的是一把恶形恶相的魔刀，刃长背厚，颜色茶黄有如琥珀，半透明的材质奇特，隐隐散发著妖邪之气；右手执著的一柄巨斧，奇形怪状，锋利无匹，充满了血腥之味。
魔刀“虎魄”、鬼斧“干戚”，这两把魔兵在蚩尤手中一点也不输天界神兵。
莫看蚩尤身材高大，手长脚长，但身手灵活犹胜九天玄女。在两把魔界神兵的帮助下，蚩尤著著抢攻，终于趁九天玄女一个疏神，打飞了昆吾剑，魔刀“虎魄”已搁在九天玄女的颈上。
哪怕是数十万年道行的真神，若被魔刀虎魄在喉咙割上一刀，九天玄女不死也得重伤，非休养三、五个月不可。毕竟宇宙同源，大部份高级生命的身体结构大同小异，尤其几个重要器官不可或缺。但是蚩尤没有伤害九天玄女，轻易便放她走路。蚩尤从来没想过有女人能够跟他战个势均力敌，心中起了惺惺相惜之意。
对于九天玄女，这一战的结果更是出人意表。要是认真再战一次，九天玄女自信一定能赢，因为两人的道行有著明显差距；然而她震慑于蚩尤的战意和勇悍，战败亦是不争的事实。九天玄女并没有因此而感到羞耻，反而觉得理所当然。
蚩尤展现出来的是人类甚至众神所欠缺的粗犷、野性和霸道，却没有太多的心计和顾虑。就像氏族与氏族之间的战争，蚩尤凭藉实力勇往直前，不去考虑甚么战略和兵法，结果取得胜利比谁都多。
另一方面，不工心计的蚩尤并非愚鲁之辈，往往闻一而知十，勉强要批评的话，只能说他的心思快而不密。蚩尤豪气干云、快人快语，对朋友推心置腹，很快便引九天玄女为红颜知己。
一个人生活了二十万年的九天玄女，虽然有明显性征，有时候仍然怀疑自己的性别。这并不奇怪，宇宙中尽有雌雄同体的生物，也有好像精灵般无须交合繁殖的族类。九天玄女没有同类，对其身世可说是一无所知，会怀疑亦是理所当然。直到有一日，事情终于发生了，九天玄女才肯定自己也是一个女人。
有道是好景不常。过不了几天，九天玄女接到天帝的指示，要她尽快帮助轩辕黄帝战胜蚩尤，回虚无天界覆命。九天玄女心中很是犹疑，她由衷觉得蚩尤的才华极佳，无论文、武均比轩辕黄帝优胜。但她转念一想：虚无天界如何不知道这事实？要不然，也不会要她下凡来辅助轩辕黄帝，因为若是公平对战，轩辕黄帝必输无疑。可惜蚩尤是魔族与人类女子交媾而生，而轩辕黄帝却曾跟天人学道，两人在诸神心目中的地位和形象可谓是云泥之别、差天共地。
九天玄女明白到虚无天界的绝对权威，断不容许她违抗上命，更何况即使她拒不从命，天帝仍会派来第二位、第三位天神帮助轩辕黄帝。正自苦恼间，九天玄女见到蚩尤消灭了一支轩辕黄帝的军队，那可真是意气风发。九天玄女再三思量，觉得蚩尤虽有通天彻地之能，但其个性刚愎自用、锋芒毕露，终究不是治国之材，只能做一方霸主。因此她下定决心，将仙术“奇门遁甲”及神兵昆吾剑也赠予轩辕黄帝，并告诉他有关蚩尤的情报。
涿鹿之战中，天帝派遣了圣龙界的龙将应龙，与及神将女魃帮助轩辕黄帝，把整个局势都扭转了。虽然蚩尤勇武，以一人之力支撑大局，并打倒神将女魃，但其族仍节节败退。蚩尤要力挽狂澜，冲破数层如铁桶般严密的防线，直奔轩辕黄帝面前，要跟他单打独斗、一决雌雄。
这一战强弱悬殊、胜负分明，蚩尤的实力远高于轩辕黄帝，轩辕黄帝根本无从招架。但是轩辕黄帝却在众目睽睽之下使出仙术奇门遁甲，令到蚩尤的攻击完全无效。蚩尤正自惊疑，忙举手中两把魔兵，虎魄和干戚往轩辕黄帝身上招呼。
当魔刀、鬼斧齐被轩辕黄帝架住，蚩尤心中的诧异非笔墨所能形容；待他看清楚轩辕黄帝手中的乃是昆吾剑，更是如半空中突然打了一个焦雷，脑袋变得一片空白。轩辕黄帝就趁这空档，一剑将蚩尤从坐骑飞虎上面挑下来。
九天玄女把昆吾剑送给轩辕黄帝，是因为只有天界神兵才能敌住虎魄、干戚两把魔兵，人类武器起不了作用；另一个原因，是希望蚩尤见到昆吾剑后能够知难而退，保住性命。九天玄女猜不到昆吾剑带给蚩尤的震憾是如此巨大，令他在瞬间失去反应而被刺伤；她更没料到的是，平日厚道的轩辕黄帝，这次会赶尽杀绝。
轩辕黄帝杀了蚩尤，成为人世间的东方皇者。九天玄女短暂的感情失落了，也回到虚无天界。自此以后，九天玄女没了以往的孤僻，脾气却变得更差，因而有了“恶女”之名。至于蚩尤原来没死，自愿留在寒冰地狱一事，九天玄女和王天君也毫不知情。
“即使你知道我和蚩尤的过去也没有用，我有没有儿子难道自己也也不知道？三界五行之间下哪有这事情？”
“的确有啊！”王天君冷笑著说道：“只是你不明白魔族而矣。”
九天玄女没立即说话，一双眼睛紧盯著王天君不放。
“魔族虽分阴、阳二性，亦喜欢交合，但是魔族的雌体和雄体均能进行繁殖。”王天君扬了扬手，说道：“魔族在交合中互相换取对方的遗传因子，然后在体内孕育出魔蛋……雄性魔族会从口中吐出魔蛋。”
九天玄女霍地抬头：“你说蚩尤他用我的遗传因子制造魔蛋？”
王天君咬了咬牙，缓缓说道：“蚩尤在涿鹿之战前吐出了魔蛋，岂料他被轩辕黄帝打败，魔蛋也在乱军中遗失了。”
九天玄女实在是无法相信，喃喃说道：“魔蛋里的当然是你吧！你竟然直呼自己父亲的名字……”
“魔族不计较这些！”王天君哈哈大笑：“最重要我连他也恨上了！如果蚩尤不是如此软弱，又怎会输给轩辕黄帝？我也会继承他成为地上的皇者！而不是被人所厌恶的怪物！”
九天玄女两眼发呆似的望著王天君，久久不能言语。自有记忆以来，九天玄女已习惯独个儿生活，对于“亲情”二字完全没有概念，她以为自己是独一无二的个体生命，没想过可以生育、繁衍后代。陡然间不知从哪里跑出一个儿子来，此事如何能够相信？更有甚者，这儿子竟是她一直讨厌的王天君，就更难以接受了。
九天玄女并非鄙视魔人，怎么说她也曾经为蚩尤著迷；何况王天君的魔族血统比蚩尤更少？九天玄女讨厌的只是王天君本人罢了。同是魔人，蚩尤行事光明正大，教人心折；王天君却是鬼鬼祟祟，令人恶心。
“接受不到吧！我是你的儿子这回事。”王天君不屑地笑道：“没相干！即使你不认我也没关系，横竖我也没打算认你这个母亲。这些年来我不是一直隐瞒著吗？”
九天玄女始终觉得难以置信，只是王天君的说话与当日情形丝丝入扣，她不得不一再求证：“你是何时知道自己身世的？你不是在蚩尤死后才出生吗？”
王天君从怀里取出一个玻璃球，解释道：“童年时受尽人类欺负，我终于忍不住大开杀戒，一夕间血洗了我所居住的村庄。后来我师父收了我作弟子，替我追查身世，终于发现我乃蚩尤之子。至于九天玄女的事，我几经辛苦才查出来。”
王天君的师父应该不是魔族，观乎他拥有法器金刚降魔杵，与及能够使出“金摩金摩金摩”这种正派的神技，便知一二。
九天玄女望著王天君，心中百般滋味。灰白脸色、深深的眼窝、细小而透明的眼珠子、矮小的身躯，还有那令人不寒而栗的笑容，无论如何也惹人讨厌，九天玄女实在无法改变自己的感觉。如果宇宙的意志真替自己安排一个儿子，而这儿子遍生是王天君，实在是“天意弄人”。九天玄女见王天君双眼直盯著自己，自觉要有所表示：“你……这些年来你受苦了……”
“九天玄女，你不懂得表现母爱，也就算吧！”王天君作难受状：“受不了……这种对话不适合你也不适合我，听著让人想吐！”
九天玄女只想表达善意，被王天君一句顶了回来，自是气极，“若是如此，你为么要告诉我这些事情？”
“别忘了是你问我的来历，我只是满足你而矣。”
“你曾说要向我和虚无天界复仇，难道天界有负于你？”
“虚无天界支持轩辕黄帝，你也在最后关头背叛了蚩尤，令到结局不同了……要不是这样，我便是地上皇者的继承人，而不是被人类所欺负的怪物！”王天君神情更是冰冷：“只因为蚩尤的魔族血统，就被天界针对……我要以魔人身份在天界办事，争这一口气。当我地位比其他天人、神龙都要高的时候，我就感到一阵快意。”
“你若为此而投靠雷帝，只怕会得不偿失！我不以为雷帝真心信任你，你们不过是互相利用罢了。”
王天君捧著玻璃球，微笑道：“那又如何？我甚么时候又把雷帝当作恩人了？先借雷帝上位，同时为他卖命，正是各取所需……这个宇宙之中，我们本来就是互相利用，难道你不是这样吗？”
王天君改口不再尊称雷帝作“大人”，九天玄女感到王天君那隐藏在阴谋后面的疯狂：“果然是魔人……你自以为聪明绝顶，智珠在握，其实目光短浅。所谓善恶到头终有报，你最终会被你那龌龊的想法害死！”
“善恶到头终有报？”王天君指著九天玄女，冷笑道：“笑话！何谓善恶是你说了算数？你帮助轩辕黄帝打败蚩尤，便是理所当然的正义？在我来说你们才是万恶……如果真的有报，你们的报应要来了！我就是执行这报应的人。你以为我甘于当雷帝的走狗吗？很快连雷帝也要向我俯首称臣！”
九天玄女以为自己听错了：“你想要的还不只此？难道你真要颠覆虚无天界？你知道自己在做甚么吗？”
“早在进入虚无天界的一刻开始，已在等候今天的来临。”王天君走近九天玄女：“我说过要争一口气，不会满足于当个区区神官。你说我贪得无厌也可以，但蚩尤只差一点便成为地上皇者，本来应该继承其位的我，目标只有一个──取代雷帝三界五行中唯我独尊的天界领袖！”
九天玄女一阵错愕，然后猛摇头道：“你知道自己在说甚么？即使你心机算尽，也没可能办到……天界领袖是初神和宇宙的意志拣选出来，万年以前已是天帝、王母和雷帝三人。即使天帝和王母离开了，雷帝也是拥有数十万年道行的真神，你这星星之火敢与日月争光？雷帝绝不是凭你那些计谋和微不足道的力量便能够拉下来的！”
“我也想继续静待时机，看准机会才行动，但我已等不及了！本来一切都很顺利，可是纳兰龙的出现把事情都搞和了。好不容易被雷帝打倒，他竟然会复活过来。结果我为了对付他而使出神技‘金摩金摩金摩’，这一招暴露了我的秘密，既然你察觉到了，只怕连雷帝也瞒不下去。”
“王天君！我看不到你有任何胜算，除了雷帝，还有我、老子、瑶姬等真神级的人存在，谁都不会任你胡作非为。看著你做愚蠢的事，不如由我来打倒你！”
“我早想要收拾你。”王天君一脸不在乎：“如果能够把你打倒，那代表我有能力与雷帝竞争吧？”
九天玄女实在不知道王天君哪里来的自信。
“我没有把握不会出手。虽然无法填补道行上的巨大差距，但我仍然可以取胜。”王天君不怀好意的笑道：“我有秘密武器，这时候不怕告诉你……天眼系统不能监视虚空岛，何况泰安殿便是天眼系统的中枢。九天玄女，我知道无法凭实力打败你们这些真神，因此我暗中修炼仙术和法宝，尤其是心灵感应术……”
“所以变成痴呆的华光太子和受到控制的沉香太子，的确是你的杰作！”看见王天君得意的笑容，九天玄女厌恶地说：“没用的！谁不知道天界最强的心灵感应术便是瑶姬？瑶姬的道行虽然较差，但也远胜于你，更何况心灵感应……”
王天君说：“我知道瑶池仙子心灵感应术的厉害，但我也有法子解决她！来到泰安殿前，我已把瑶池仙子的精神封琐，如今她跟华光一样变成了白痴！”
九天玄女吃了一惊，伸手抓住王天君的衣领，喝道：“你说甚么？”
王天君拍开九天玄女的手，冷冷说道：“我在妙玄宫附近遇上瑶池仙子……看你的神情似乎不相信我控制了瑶池仙子。的确她的心灵感应术胜我一筹，但我乘虚而入，打败了她。”王天君本不想向瑶姬动手，但瑶姬却先用心灵感应来试探他。王天君无法强行攻入瑶姬的思想里面，但瑶姬主动进入他的脑部，反而让自己的意识打开，给予他反击的机会。
九天玄女不知道内情，满腹都是疑团。她不以为王天君可以在战斗中胜过自己；相反，连瑶姬也抵挡不了的心灵控制，足以让王天君称霸宇宙。九天玄女不知道，王天君控制华光和沉香已是他的极限，若不取巧难以对付真神：“你想要连雷帝也操控？王母离开以后，雷帝许多令人无法接受的决定，其实是你干的好事？”
“不！直到现在为止，雷帝所有决定均是他个人意愿。我只是对雷帝作出有限度暗示罢了。任何人的内心深处均是光影交织，问题倾向哪一面多些。即使正义的人。雷帝的个性比你我估计还要极端，接近人格分裂。过去数千年来，雷帝时刻警剔自己，保持低调；但只要对其偏激思想稍加推波助澜，一切都会变得不同。”
九天玄女早就觉得雷帝像是回复帝释天时期的行事作风，奇怪的是经历万年后，雷帝为何突然转变？原来是王天君以心灵感应术影响雷帝！
“你打算煽动雷帝，趁机制造混乱，好让你从中得利？”
“可以这样说，我的计划更周详。”王天君耸了耸肩，道：“未来一段日子，雷帝会因为倒行逆施而众叛亲离，我将会扮演雷帝最忠实的唯一追随者，并以他的实力打倒所有阻挠我大业的人，包括你和老子……可惜纳兰龙破坏了我的计划，令我要及早收拾残局。我要先下手为强，尽快收拾所有真神，否则我便要倒霉了。”
“雷帝注视著你与纳兰龙的战斗，定必对你起疑，你已没机会了！”
“雷帝思想偏激，再受到纳兰龙、哪吒和杨戬的刺激，已失去冷静，我要控制他的思想变得非常容易。”王天君说：“至于你，我……”
九天玄女举起右手：“我已经知道你的技俩了！在你侵入我的思想前，一招神技已将你杀死。”
“不愧为九天玄女，连自己的儿子也能杀死。”王天君将玻璃球掷到九天玄女的脚边：“我用辛苦炼成的法宝对付你。”
玻璃球掉到地上，发出清脆的声响。在玻璃碎裂的同时，里面流出了大量半透明的液体，溅到九天玄女的裙摆之上，并且迅速活化、蔓延，瞬间已爬满九天玄女全身。不但如此，连四周的空气也变得奇怪，除了本来的液体以几何级数的速度增加，彷佛空气也凝固起来。
九天玄女虽没亲眼见过，却曾听王母提及，不禁叫道：“这……这是初神遗留下来的法宝‘五行蛋晶’？”
玻璃球里面是一种懂得自我繁殖、拥有记忆体的物质“白精”，只要受到撞击再与空气接触，立即便会活化，吞食附近的事物，其“食量”则看白精的数量而定。由于白精拥有记忆体，能够随意改变自己的分子结构，使之变成不同属性。
看著九天玄女在两、三秒间被白精所包围，然后变成一个水晶像──那些白精在吞食了九天玄女后逐渐凝固，并且完全变成透明──王天君心里感觉舒畅。他想不到“五行蛋晶”这么有效，不枉他潜入九龙壁将之盗出来。
“我自知永远无法及得上你们这些真神，但我比你们都要聪明，这个天界很快便属于我的了！”
在天宫的核心地方，灵霄宝殿的鬼斧神工已然启动，变成一个足以容纳万人的巨大广场。其中纳兰龙正与二十余个天君、雷将周旋，而杨戬、哪吒和雷帝正在旁边观战。
当此之时，雷帝自然没机会留意天眼系统的报告，而天眼系统并不覆盖虚空岛，因此在泰安殿旁发生的事，雷帝并不知悉。九天玄女、瑶姬两位真神，不为人知的已被王天君所收拾。
纳兰龙的出现破坏了王天君原先的计划。想当日纳兰龙继承敖玉的龙魂，令到平静已久的虚无天界闹得热哄哄的，王天君趁机争取对付纳兰龙的差使，其实是有心激反纳兰龙，制造冲突好令雷帝失去人心，同时找机会铲除有实力的人。结果哪吒首先被牵连，而华光和沉香亦落入他的掌心。
另一方面，不断变强的纳兰龙在打倒毗娑婆、敖琉、地煞神和广目天后，终于被雷帝杀死，亦是个不错的结果。王天君担心让他继续进步，早晚会超出自己的控制。
谁料纳兰龙再次到人世，实力果然更上一层楼。王天君在战斗中不敌，使出一直隐藏的神技“金摩金摩金摩”，不但未能打败纳兰龙，反而暴露了自己的秘密。但是王天君没有气馁，他含糊其辞有责任全推到雷帝身上，使得纳兰龙、杨戬和哪吒三人前去灵霄宝殿质问雷帝。如此一来，雷帝没时间过问王天君关于金刚降魔杵和金摩金摩金摩的事，连带华光和沉香的问题也搁到旁边去。王能够争取时间另谋对策，搞不好还可以暗算雷帝，把他也控制了。
纳兰龙虽然对王天君充满了敌意，尤其王天君是杀死拉比的凶手。但是纳兰龙深信王天君只是从犯而矣，真正的主谋应该是雷帝。
而再与雷帝战斗前，先要打倒面前这些天君、雷将和灵霄宝殿四大元帅。
雷帝座下有二十四天君、三十六雷将。其中雷将只是二级神将，实力与敖玉同级的纳兰龙，轻易便干掉其中二人，更把秦天君一条手臂卸了下来。天君属一级神官，虽然其余二十三人没王天君那么厉害，但他们各有绝技、法宝和仙术，比雷将难缠多。
纳兰龙正被辛天君、陶天君和金光圣母夹击，不能有丝毫大意。
陶天君以法宝“聚风幡”令到广场上的气流变得急劲，令到纳兰龙无法站稳。偏生辛天君拥有法宝“天翔翼”，金光圣母拥有法宝“定风珠”，两人皆能在强劲的风势中来去自如，使纳兰龙处于最于最大的劣势。
就在这时候，纳兰龙使出新防技“水晶球”，将辛天君的练锤和金光圣母的金飞剑挡住。水晶球和冰壁相似，却像一个肥皂泡般把纳兰龙完全保护，四面八方均不能伤他。
就在众人惊愕之际，纳兰龙举起右拳，全力打出白龙钢弹，从里面将水晶球打穿，直射到辛天君胸口。辛天君反应不及，被白龙钢弹贯穿身体，连带安装在他背上的法宝天翔翼也给轰至粉碎！
雷帝见纳兰龙举臂，已知道他要使出神技，然而提醒的说话才出口，辛天君已被打倒。雷帝怒不可遏，大吼一声，便从须弥座飞起，直扑到纳兰龙头顶！